ProImmune 针对 II 类等位基因的 MHC 肽结合测定是一种强大的无细胞体外测定,可以快速预测任何蛋白质序列中的 CD4+ T 细胞表位。该测定法确定了蛋白质序列中最可能的免疫原性肽,因此可以在新型免疫疗法的开发中发挥关键作用。当应用于治疗性蛋白质时,该信息可用于帮助开发用于 T 细胞表位消耗的蛋白质工程策略,以避免不良反应和中和抗体。
HLA 肽结合测定可与开/关速率测定或稳定性测定相结合,以提供有关在表位发现过程中鉴定的各个肽的结合特征的深入信息。
该技术广泛适用于癌症、传染病、自身免疫和移植等许多疾病领域,非常适合具有严格时间压力的治疗方案。
与发现 T 细胞抗原的传统方法(例如功能性细胞测定)不同,这些测定不消耗宝贵的患者样本,并且具有在单个步骤中确定每种抗原的 HLA 限制的优势。因此,该技术可显着节省时间,并有助于降低表位发现项目的总体成本和风险。
结合测定可用于 26 HLA-DR、11 -DQ 等位基因和 19 -DP 等位基因(完整列表见下表),以及小鼠 II 类等位基因 H-2 Iab 和 IAd。
尽管有广泛的结合预测算法可用于肽与 II 类 HLA 等位基因的结合,但这些计算机方法的准确性并不总是与物理结合数据密切相关。 ProImmune REVEAL® II 类 HLA 结合测定通过确定肽序列是否与 HLA 等位基因结合来克服这些限制,因此消除了算法方法产生的高比例假阳性和假阴性结果的严重问题。
HLA 肽结合测定需要一组合成肽,这些肽由 ProImmune 作为服务的一部分提供。肽序列从已知蛋白质生成为重叠肽库。 ProImmune 的技术顾问可以协助设计适合您感兴趣的蛋白质的肽库。
高通量 HLA 肽结合测定是一项定制服务,可确定与阳性和中间对照肽相比,每个候选肽与一个或多个 II 类 HLA 等位基因结合的能力。该测定是对每种肽稳定HLA-肽复合物的能力的测量。检测是基于这种 HLA-肽复合物的天然构象的存在与否。
目前有 56 个 DR、DQ 和 DP 等位基因可用于 HLA 肽结合测定。
Table 1. 显示当前可用于 II 类 HLA 肽结合测定的等位基因。
每个肽都有一个相对于阳性对照肽的分数,阳性对照肽是一个已知的 T 细胞表位。此外,显示了中间对照肽的结果以供比较。中间对照是已知的 T 细胞表位,或者在某些 II 类等位基因的情况下,是等位基因 α 和 β 对中 β 链的已知表位。分数被定量报告为测试肽相对于阳性对照肽产生的信号的百分比。客户可以选择任何或所有通过 HLA 肽结合测定的肽进行进一步的速率或稳定性测定。
结合测定也可用于两个小鼠等位基因,H-2 Iab 和 H-2 IAd。
ProImmune REVEAL® II 类完整率测定
结合和分离率分析将提供有关单个肽结合特性的动力学信息。这些测定对于中亲和肽可能特别重要,与高亲和肽相比,与特定 HLA 等位基因的结合可能较慢。如果还观察到缓慢的解离速率,这表明一旦肽被结合,它可以呈现相当长的一段时间,因此值得进一步研究作为潜在的表位。不能保证具有快速启动率的肽是更好的表位。对它们的动力学进行更详细的研究可能会揭示它们也具有快速的解离速率,这意味着它们可能不是很好的候选表位。如果用于最终表位验证的细胞样本在供应率方面受到限制,则分析数据也可用于优先处理最有希望的候选肽的下游工作。完整的速率测定可用于以下 II 类等位基因:
DR1 (DRB1*01:01), DR2 (DRB1*15:01), DR3 (DRB1*03:01), DR4 (DRB1*04:01) DRB1*04:05, DR5 (DRB1*11:01), DR7 (DRB1*07:01)、DR9 (DRB1*0901)。
Quick Check Stability Assay 适用于任何 DR、DQ 和 DP II 类等位基因,并且必须与模块 2:HLA 肽结合测定同时订购。稳定性测定在 37°C 下测量在 0 时间和 24 小时时间与等位基因结合的肽量,并给出 HLA-肽复合物稳定性的指示。每个肽都有一个“稳定性指数”,可以比较不同肽表位的相对稳定性。
HLA-肽结合试验比组装复合物的稳定性更能反映肽的结合率特性。然而,当结合稳定性测定和结合测定的结果时,随后的数据提供了关于肽是否可以呈递足够长的时间以使其成为良好的 T 细胞表位的更完整信息。该指数提供了一种方法,用于比较被测量等位基因中不同肽的结果。结果可以作为一种具有成本效益的方法来优先考虑哪些肽值得在功能性细胞测定中进一步研究,并使用户能够优化细胞样本的使用和测试所需的时间。
在通过 HLA 肽结合测定法鉴定结合肽后,可以使用细胞测定法(例如 ELISpot、细胞内细胞因子染色和 T 细胞增殖测定法)确认那些是功能性 T 细胞表位的肽。 ProImmune 提供所有这些检测作为一系列细胞分析服务的一部分。虽然对患者细胞的最终验证总是需要相关细胞样本的资源和实验室时间,但来自 HLA 肽结合和速率测定的数据有助于将这些资源用于最佳利用。
ProImmune REVEAL® II 类定制服务是根据客户的个性化需求量身定制的。联系我们为您的项目提供具体报价。请求报价